《南京郵電大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版）》曾獲得全國(guó)高校優(yōu)秀科技期刊“優(yōu)秀編輯出版質(zhì)量獎(jiǎng)、Caj-cd規(guī)范期刊、第二屆江蘇期刊方陣“優(yōu)秀提名期刊”、首屆中國(guó)高校特色科技期刊獎(jiǎng)、第六屆江蘇省優(yōu)秀期刊“編校質(zhì)量一等獎(jiǎng)”、全國(guó)高校優(yōu)秀科技期刊“優(yōu)秀編輯質(zhì)量獎(jiǎng)”、工業(yè)與信息化部“編輯質(zhì)量獎(jiǎng)”、江蘇期刊“明珠獎(jiǎng)·優(yōu)秀選題策劃”、江蘇科技期刊“金馬獎(jiǎng)·特色期刊獎(jiǎng)”和“選題策劃獎(jiǎng)”、中國(guó)高校優(yōu)秀科技期刊等獎(jiǎng)項(xiàng)。