《生態毒理學報》是中國科學院生態環境研究中心主辦的學術性刊物（雙月刊），為中文核心期刊。2006年創刊，迄今為止，《生態毒理學報》是我國唯一的一本專門報道生態毒理學領域研究成果的學術期刊。目前，被“中文核心期刊要目總覽（中文核心期刊）”、“中國科技核心期刊（中國科技論文統計源期刊）”、“中國科學引文數據庫（CSCD）”、“美國化學會的化學文摘（Chemical Abstracts）”、“美國生物學文摘（Biological Abstracts）”、“美國生物學文摘數據庫（BIOSIS Previews）”、“日本科學技術振興機構數據庫(JST)”、“美國烏利希國際期刊指南（Ulrich's Periodicals Directory）”、“英國動物學記錄（Zoological Record）”等收錄。

創刊以來的10余年中，學報一直致力于追蹤、報道我國環境風險與生態毒理學領域的科技工作者取得的創新性研究成果及新技術與新方法，匯集了許多學科前沿成果，記錄了近年來我國生態毒理學的發展歷程。