被美國醫(yī)學(xué)索引/生物醫(yī)學(xué)檢索(Medline/PubMed)、Elsevier全文數(shù)據(jù)庫(Scopus)、美國化學(xué)文摘(CA)、歐洲生物醫(yī)學(xué)檢索(Europe PMC)、中國科技核心期刊(中國科技論文統(tǒng)計(jì)源期刊)、中文核心期刊要目總覽(北大核心目錄)、中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫(CSCD)、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBM)等多種國內(nèi)外知名的檢索系統(tǒng)和數(shù)據(jù)庫收錄。《中華流行病學(xué)雜志》入選了“中國科技期刊卓越行動(dòng)計(jì)劃”。2012-2018年，《中華流行病學(xué)雜志》連續(xù)榮獲“百種中國杰出學(xué)術(shù)期刊”、“中國國際影響力優(yōu)秀學(xué)術(shù)期刊”等。